JavaScript узнать закрыто ли окно (вкладка) браузера из другого окна

Можно воспользоваться механизмом postMessage см. webonrails.ru/post/1925/

Например при закрытии окна срабатывает событие onbeforeunload. Мы его можем отловить.

window.onbeforeunload = function() {
window.opener.postMessage('closed', 'http://www.example.com');
};

Ну, а в основном окне ловим наше сообщение.

window.addEventListener('message', function(event) {
if( event.origin != 'http://www.example.com' ) return;
if( event.data == 'closed' ) {
alert('popup окно было закрыто');
}
}, false);

Разумеется это работает только с popup окнами. Окнами открытыми программно из основного окна.
По другому, только если на ActionScript отслеживать, там есть механизм обмена данными между запущенными флешками.